Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNA1P35221 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNA1P35221 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA1P35221 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms