Protein–RNA interactions for Protein: P34096

RNASE4, Ribonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4P34096 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNASE4P34096 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNASE4P34096 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms