Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD34P28906 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD34P28906 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD34P28906 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD34P28906 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD34P28906 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD34P28906 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD34P28906 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD34P28906 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD34P28906 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD34P28906 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD34P28906 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD34P28906 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD34P28906 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD34P28906 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD34P28906 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms