Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRP12270 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRP12270 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRP12270 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRP12270 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRP12270 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPRP12270 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRP12270 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRP12270 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPRP12270 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRP12270 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRP12270 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRP12270 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRP12270 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPRP12270 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRP12270 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRP12270 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRP12270 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRP12270 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRP12270 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRP12270 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRP12270 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRP12270 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRP12270 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRP12270 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms