Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41P11171 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41P11171 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41P11171 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41P11171 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41P11171 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41P11171 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41P11171 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41P11171 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41P11171 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41P11171 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41P11171 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41P11171 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41P11171 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41P11171 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41P11171 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41P11171 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41P11171 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41P11171 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41P11171 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41P11171 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41P11171 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41P11171 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41P11171 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41P11171 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41P11171 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41P11171 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41P11171 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41P11171 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms