Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCELO95171 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCELO95171 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCELO95171 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCELO95171 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCELO95171 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCELO95171 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCELO95171 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCELO95171 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCELO95171 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCELO95171 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SCELO95171 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCELO95171 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCELO95171 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCELO95171 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCELO95171 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCELO95171 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCELO95171 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCELO95171 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCELO95171 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCELO95171 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCELO95171 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCELO95171 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCELO95171 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCELO95171 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms