Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOX15O60248 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOX15O60248 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOX15O60248 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOX15O60248 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOX15O60248 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SOX15O60248 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOX15O60248 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOX15O60248 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX15O60248 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX15O60248 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX15O60248 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX15O60248 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX15O60248 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX15O60248 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOX15O60248 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOX15O60248 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX15O60248 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms