Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF1CO43896 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF1CO43896 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms