Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC25A20O43772 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC25A20O43772 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC25A20O43772 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC25A20O43772 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC25A20O43772 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC25A20O43772 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC25A20O43772 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC25A20O43772 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC25A20O43772 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC25A20O43772 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC25A20O43772 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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