Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD28O15084 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD28O15084 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD28O15084 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD28O15084 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD28O15084 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD28O15084 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms