Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms