Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLR4O00206 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR4O00206 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR4O00206 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR4O00206 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR4O00206 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR4O00206 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR4O00206 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLR4O00206 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR4O00206 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR4O00206 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR4O00206 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR4O00206 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR4O00206 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR4O00206 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR4O00206 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR4O00206 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR4O00206 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR4O00206 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR4O00206 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR4O00206 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR4O00206 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR4O00206 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR4O00206 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR4O00206 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR4O00206 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR4O00206 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR4O00206 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR4O00206 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR4O00206 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR4O00206 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR4O00206 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR4O00206 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR4O00206 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR4O00206 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR4O00206 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR4O00206 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR4O00206 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR4O00206 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR4O00206 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR4O00206 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR4O00206 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR4O00206 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR4O00206 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR4O00206 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR4O00206 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR4O00206 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR4O00206 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR4O00206 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms