Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIT2A6NDA9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms