Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMX2A2RU54 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms