Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TNFRSF11AQ9Y6Q6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms