Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms