Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DYNC1LI1Q9Y6G9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DYNC1LI1Q9Y6G9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms