Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y698

CACNG2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG2Q9Y698 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG2Q9Y698 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG2Q9Y698 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG2Q9Y698 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG2Q9Y698 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG2Q9Y698 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG2Q9Y698 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG2Q9Y698 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG2Q9Y698 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG2Q9Y698 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG2Q9Y698 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG2Q9Y698 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG2Q9Y698 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG2Q9Y698 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG2Q9Y698 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNG2Q9Y698 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNG2Q9Y698 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNG2Q9Y698 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNG2Q9Y698 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNG2Q9Y698 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNG2Q9Y698 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNG2Q9Y698 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG2Q9Y698 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG2Q9Y698 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG2Q9Y698 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG2Q9Y698 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG2Q9Y698 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG2Q9Y698 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms