Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTNQ9Y639 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPTNQ9Y639 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPTNQ9Y639 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPTNQ9Y639 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPTNQ9Y639 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPTNQ9Y639 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTNQ9Y639 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTNQ9Y639 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTNQ9Y639 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTNQ9Y639 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTNQ9Y639 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTNQ9Y639 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTNQ9Y639 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPTNQ9Y639 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPTNQ9Y639 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTNQ9Y639 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPTNQ9Y639 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms