Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUBP2Q9Y5Y2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUBP2Q9Y5Y2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUBP2Q9Y5Y2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUBP2Q9Y5Y2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUBP2Q9Y5Y2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUBP2Q9Y5Y2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUBP2Q9Y5Y2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUBP2Q9Y5Y2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUBP2Q9Y5Y2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUBP2Q9Y5Y2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUBP2Q9Y5Y2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUBP2Q9Y5Y2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUBP2Q9Y5Y2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUBP2Q9Y5Y2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUBP2Q9Y5Y2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUBP2Q9Y5Y2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUBP2Q9Y5Y2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUBP2Q9Y5Y2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUBP2Q9Y5Y2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUBP2Q9Y5Y2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUBP2Q9Y5Y2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUBP2Q9Y5Y2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUBP2Q9Y5Y2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUBP2Q9Y5Y2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUBP2Q9Y5Y2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUBP2Q9Y5Y2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUBP2Q9Y5Y2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms