Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC1Q9Y5R8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC1Q9Y5R8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC1Q9Y5R8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC1Q9Y5R8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC1Q9Y5R8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC1Q9Y5R8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC1Q9Y5R8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC1Q9Y5R8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC1Q9Y5R8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC1Q9Y5R8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms