Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NR2E1Q9Y466 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NR2E1Q9Y466 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NR2E1Q9Y466 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NR2E1Q9Y466 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NR2E1Q9Y466 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NR2E1Q9Y466 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NR2E1Q9Y466 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NR2E1Q9Y466 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NR2E1Q9Y466 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NR2E1Q9Y466 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NR2E1Q9Y466 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NR2E1Q9Y466 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NR2E1Q9Y466 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NR2E1Q9Y466 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NR2E1Q9Y466 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NR2E1Q9Y466 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NR2E1Q9Y466 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NR2E1Q9Y466 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NR2E1Q9Y466 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NR2E1Q9Y466 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NR2E1Q9Y466 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NR2E1Q9Y466 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NR2E1Q9Y466 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NR2E1Q9Y466 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NR2E1Q9Y466 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NR2E1Q9Y466 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NR2E1Q9Y466 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NR2E1Q9Y466 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR2E1Q9Y466 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NR2E1Q9Y466 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR2E1Q9Y466 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NR2E1Q9Y466 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms