Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHTOPQ9Y3Y2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHTOPQ9Y3Y2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHTOPQ9Y3Y2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHTOPQ9Y3Y2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHTOPQ9Y3Y2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHTOPQ9Y3Y2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHTOPQ9Y3Y2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHTOPQ9Y3Y2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHTOPQ9Y3Y2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHTOPQ9Y3Y2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHTOPQ9Y3Y2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHTOPQ9Y3Y2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHTOPQ9Y3Y2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHTOPQ9Y3Y2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms