Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFR3BQ9Y2G0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFR3BQ9Y2G0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFR3BQ9Y2G0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFR3BQ9Y2G0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFR3BQ9Y2G0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EFR3BQ9Y2G0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFR3BQ9Y2G0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFR3BQ9Y2G0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFR3BQ9Y2G0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFR3BQ9Y2G0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFR3BQ9Y2G0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFR3BQ9Y2G0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFR3BQ9Y2G0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFR3BQ9Y2G0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFR3BQ9Y2G0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EFR3BQ9Y2G0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFR3BQ9Y2G0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFR3BQ9Y2G0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EFR3BQ9Y2G0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFR3BQ9Y2G0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFR3BQ9Y2G0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EFR3BQ9Y2G0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFR3BQ9Y2G0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFR3BQ9Y2G0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFR3BQ9Y2G0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFR3BQ9Y2G0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFR3BQ9Y2G0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFR3BQ9Y2G0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFR3BQ9Y2G0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFR3BQ9Y2G0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFR3BQ9Y2G0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFR3BQ9Y2G0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFR3BQ9Y2G0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFR3BQ9Y2G0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFR3BQ9Y2G0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFR3BQ9Y2G0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFR3BQ9Y2G0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFR3BQ9Y2G0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EFR3BQ9Y2G0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFR3BQ9Y2G0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms