Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NUDCQ9Y266 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NUDCQ9Y266 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NUDCQ9Y266 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUDCQ9Y266 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NUDCQ9Y266 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NUDCQ9Y266 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NUDCQ9Y266 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NUDCQ9Y266 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NUDCQ9Y266 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NUDCQ9Y266 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NUDCQ9Y266 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NUDCQ9Y266 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NUDCQ9Y266 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NUDCQ9Y266 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NUDCQ9Y266 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
NUDCQ9Y266 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NUDCQ9Y266 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NUDCQ9Y266 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NUDCQ9Y266 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NUDCQ9Y266 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NUDCQ9Y266 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUDCQ9Y266 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NUDCQ9Y266 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUDCQ9Y266 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUDCQ9Y266 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUDCQ9Y266 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUDCQ9Y266 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NUDCQ9Y266 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NUDCQ9Y266 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NUDCQ9Y266 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUDCQ9Y266 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
NUDCQ9Y266 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NUDCQ9Y266 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NUDCQ9Y266 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NUDCQ9Y266 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NUDCQ9Y266 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NUDCQ9Y266 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NUDCQ9Y266 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUDCQ9Y266 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NUDCQ9Y266 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NUDCQ9Y266 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUDCQ9Y266 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUDCQ9Y266 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NUDCQ9Y266 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NUDCQ9Y266 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms