Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3LQ9Y262 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF3LQ9Y262 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF3LQ9Y262 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF3LQ9Y262 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF3LQ9Y262 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF3LQ9Y262 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3LQ9Y262 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3LQ9Y262 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3LQ9Y262 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3LQ9Y262 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3LQ9Y262 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3LQ9Y262 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3LQ9Y262 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3LQ9Y262 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3LQ9Y262 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3LQ9Y262 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3LQ9Y262 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3LQ9Y262 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3LQ9Y262 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3LQ9Y262 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3LQ9Y262 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3LQ9Y262 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF3LQ9Y262 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3LQ9Y262 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3LQ9Y262 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms