Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC8A2Q9UPR5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC8A2Q9UPR5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC8A2Q9UPR5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC8A2Q9UPR5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC8A2Q9UPR5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC8A2Q9UPR5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC8A2Q9UPR5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC8A2Q9UPR5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC8A2Q9UPR5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC8A2Q9UPR5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC8A2Q9UPR5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC8A2Q9UPR5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC8A2Q9UPR5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC8A2Q9UPR5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC8A2Q9UPR5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A2Q9UPR5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A2Q9UPR5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A2Q9UPR5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC8A2Q9UPR5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC8A2Q9UPR5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC8A2Q9UPR5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC8A2Q9UPR5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC8A2Q9UPR5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC8A2Q9UPR5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC8A2Q9UPR5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC8A2Q9UPR5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC8A2Q9UPR5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC8A2Q9UPR5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC8A2Q9UPR5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC8A2Q9UPR5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC8A2Q9UPR5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC8A2Q9UPR5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC8A2Q9UPR5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC8A2Q9UPR5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC8A2Q9UPR5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC8A2Q9UPR5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC8A2Q9UPR5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A2Q9UPR5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms