Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PDZRN3Q9UPQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PDZRN3Q9UPQ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PDZRN3Q9UPQ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PDZRN3Q9UPQ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDZRN3Q9UPQ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDZRN3Q9UPQ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDZRN3Q9UPQ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDZRN3Q9UPQ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PDZRN3Q9UPQ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDZRN3Q9UPQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDZRN3Q9UPQ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PDZRN3Q9UPQ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDZRN3Q9UPQ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDZRN3Q9UPQ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDZRN3Q9UPQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDZRN3Q9UPQ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDZRN3Q9UPQ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDZRN3Q9UPQ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PDZRN3Q9UPQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDZRN3Q9UPQ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDZRN3Q9UPQ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDZRN3Q9UPQ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDZRN3Q9UPQ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDZRN3Q9UPQ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDZRN3Q9UPQ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDZRN3Q9UPQ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PDZRN3Q9UPQ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PDZRN3Q9UPQ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDZRN3Q9UPQ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDZRN3Q9UPQ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDZRN3Q9UPQ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDZRN3Q9UPQ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDZRN3Q9UPQ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PDZRN3Q9UPQ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDZRN3Q9UPQ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDZRN3Q9UPQ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PDZRN3Q9UPQ7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PDZRN3Q9UPQ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PDZRN3Q9UPQ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDZRN3Q9UPQ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDZRN3Q9UPQ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms