Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCG2Q9UNQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCG2Q9UNQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG2Q9UNQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCG2Q9UNQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCG2Q9UNQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCG2Q9UNQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCG2Q9UNQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCG2Q9UNQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCG2Q9UNQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCG2Q9UNQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCG2Q9UNQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCG2Q9UNQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCG2Q9UNQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCG2Q9UNQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCG2Q9UNQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCG2Q9UNQ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCG2Q9UNQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCG2Q9UNQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCG2Q9UNQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCG2Q9UNQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCG2Q9UNQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCG2Q9UNQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCG2Q9UNQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCG2Q9UNQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCG2Q9UNQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCG2Q9UNQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG2Q9UNQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG2Q9UNQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCG2Q9UNQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCG2Q9UNQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCG2Q9UNQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCG2Q9UNQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms