Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE2

RPH3AL, Rab effector Noc2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3ALQ9UNE2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPH3ALQ9UNE2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPH3ALQ9UNE2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3ALQ9UNE2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3ALQ9UNE2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPH3ALQ9UNE2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPH3ALQ9UNE2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3ALQ9UNE2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3ALQ9UNE2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3ALQ9UNE2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3ALQ9UNE2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3ALQ9UNE2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3ALQ9UNE2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPH3ALQ9UNE2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPH3ALQ9UNE2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPH3ALQ9UNE2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPH3ALQ9UNE2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPH3ALQ9UNE2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPH3ALQ9UNE2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPH3ALQ9UNE2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPH3ALQ9UNE2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPH3ALQ9UNE2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPH3ALQ9UNE2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPH3ALQ9UNE2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPH3ALQ9UNE2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPH3ALQ9UNE2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPH3ALQ9UNE2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms