Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
L1RE1Q9UN81 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
L1RE1Q9UN81 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
L1RE1Q9UN81 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
L1RE1Q9UN81 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
L1RE1Q9UN81 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
L1RE1Q9UN81 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
L1RE1Q9UN81 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
L1RE1Q9UN81 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
L1RE1Q9UN81 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
L1RE1Q9UN81 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
L1RE1Q9UN81 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
L1RE1Q9UN81 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
L1RE1Q9UN81 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
L1RE1Q9UN81 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
L1RE1Q9UN81 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
L1RE1Q9UN81 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
L1RE1Q9UN81 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
L1RE1Q9UN81 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
L1RE1Q9UN81 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
L1RE1Q9UN81 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
L1RE1Q9UN81 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
L1RE1Q9UN81 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
L1RE1Q9UN81 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
L1RE1Q9UN81 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
L1RE1Q9UN81 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
L1RE1Q9UN81 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
L1RE1Q9UN81 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
L1RE1Q9UN81 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
L1RE1Q9UN81 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
L1RE1Q9UN81 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
L1RE1Q9UN81 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
L1RE1Q9UN81 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
L1RE1Q9UN81 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
L1RE1Q9UN81 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
L1RE1Q9UN81 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
L1RE1Q9UN81 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
L1RE1Q9UN81 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
L1RE1Q9UN81 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
L1RE1Q9UN81 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
L1RE1Q9UN81 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
L1RE1Q9UN81 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1RE1Q9UN81 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms