Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ALKQ9UM73 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ALKQ9UM73 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ALKQ9UM73 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ALKQ9UM73 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ALKQ9UM73 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
ALKQ9UM73 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
ALKQ9UM73 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ALKQ9UM73 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ALKQ9UM73 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ALKQ9UM73 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ALKQ9UM73 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ALKQ9UM73 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ALKQ9UM73 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ALKQ9UM73 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ALKQ9UM73 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ALKQ9UM73 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ALKQ9UM73 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ALKQ9UM73 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
ALKQ9UM73 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ALKQ9UM73 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ALKQ9UM73 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ALKQ9UM73 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ALKQ9UM73 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ALKQ9UM73 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ALKQ9UM73 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
ALKQ9UM73 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ALKQ9UM73 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ALKQ9UM73 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ALKQ9UM73 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ALKQ9UM73 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
ALKQ9UM73 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ALKQ9UM73 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
ALKQ9UM73 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ALKQ9UM73 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
ALKQ9UM73 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ALKQ9UM73 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ALKQ9UM73 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ALKQ9UM73 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ALKQ9UM73 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ALKQ9UM73 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ALKQ9UM73 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ALKQ9UM73 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ALKQ9UM73 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ALKQ9UM73 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ALKQ9UM73 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ALKQ9UM73 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ALKQ9UM73 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ALKQ9UM73 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ALKQ9UM73 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
ALKQ9UM73 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
ALKQ9UM73 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.05■■■■■ 4
ALKQ9UM73 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ALKQ9UM73 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
ALKQ9UM73 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
ALKQ9UM73 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40■■■■□ 3.99
ALKQ9UM73 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ALKQ9UM73 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ALKQ9UM73 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ALKQ9UM73 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ALKQ9UM73 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ALKQ9UM73 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ALKQ9UM73 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ALKQ9UM73 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
ALKQ9UM73 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
ALKQ9UM73 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
ALKQ9UM73 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ALKQ9UM73 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ALKQ9UM73 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ALKQ9UM73 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ALKQ9UM73 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ALKQ9UM73 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.73■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
ALKQ9UM73 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
ALKQ9UM73 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms