Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MGAT4AQ9UM21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGAT4AQ9UM21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MGAT4AQ9UM21 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MGAT4AQ9UM21 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MGAT4AQ9UM21 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MGAT4AQ9UM21 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MGAT4AQ9UM21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT4AQ9UM21 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT4AQ9UM21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MGAT4AQ9UM21 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT4AQ9UM21 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT4AQ9UM21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT4AQ9UM21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4AQ9UM21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT4AQ9UM21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT4AQ9UM21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT4AQ9UM21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT4AQ9UM21 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT4AQ9UM21 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MGAT4AQ9UM21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MGAT4AQ9UM21 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT4AQ9UM21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT4AQ9UM21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MGAT4AQ9UM21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGAT4AQ9UM21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGAT4AQ9UM21 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGAT4AQ9UM21 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MGAT4AQ9UM21 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGAT4AQ9UM21 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGAT4AQ9UM21 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGAT4AQ9UM21 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGAT4AQ9UM21 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGAT4AQ9UM21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT4AQ9UM21 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGAT4AQ9UM21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MGAT4AQ9UM21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms