Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB23Q9ULC3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB23Q9ULC3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB23Q9ULC3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB23Q9ULC3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB23Q9ULC3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB23Q9ULC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB23Q9ULC3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB23Q9ULC3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB23Q9ULC3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB23Q9ULC3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB23Q9ULC3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB23Q9ULC3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB23Q9ULC3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB23Q9ULC3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB23Q9ULC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB23Q9ULC3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB23Q9ULC3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB23Q9ULC3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB23Q9ULC3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB23Q9ULC3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB23Q9ULC3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB23Q9ULC3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB23Q9ULC3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB23Q9ULC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB23Q9ULC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB23Q9ULC3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB23Q9ULC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB23Q9ULC3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB23Q9ULC3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB23Q9ULC3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB23Q9ULC3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB23Q9ULC3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB23Q9ULC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB23Q9ULC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB23Q9ULC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB23Q9ULC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB23Q9ULC3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB23Q9ULC3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB23Q9ULC3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB23Q9ULC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB23Q9ULC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB23Q9ULC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB23Q9ULC3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB23Q9ULC3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB23Q9ULC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB23Q9ULC3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB23Q9ULC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB23Q9ULC3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB23Q9ULC3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB23Q9ULC3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB23Q9ULC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB23Q9ULC3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB23Q9ULC3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB23Q9ULC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB23Q9ULC3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB23Q9ULC3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB23Q9ULC3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB23Q9ULC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB23Q9ULC3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB23Q9ULC3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB23Q9ULC3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB23Q9ULC3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB23Q9ULC3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB23Q9ULC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB23Q9ULC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB23Q9ULC3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB23Q9ULC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms