Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HCN2Q9UL51 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
HCN2Q9UL51 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HCN2Q9UL51 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HCN2Q9UL51 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HCN2Q9UL51 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HCN2Q9UL51 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HCN2Q9UL51 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HCN2Q9UL51 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HCN2Q9UL51 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCN2Q9UL51 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HCN2Q9UL51 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HCN2Q9UL51 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HCN2Q9UL51 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HCN2Q9UL51 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HCN2Q9UL51 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HCN2Q9UL51 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCN2Q9UL51 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HCN2Q9UL51 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCN2Q9UL51 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HCN2Q9UL51 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCN2Q9UL51 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCN2Q9UL51 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HCN2Q9UL51 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HCN2Q9UL51 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HCN2Q9UL51 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HCN2Q9UL51 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HCN2Q9UL51 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HCN2Q9UL51 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HCN2Q9UL51 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HCN2Q9UL51 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HCN2Q9UL51 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HCN2Q9UL51 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HCN2Q9UL51 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HCN2Q9UL51 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HCN2Q9UL51 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HCN2Q9UL51 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HCN2Q9UL51 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HCN2Q9UL51 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HCN2Q9UL51 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms