Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CROTQ9UKG9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CROTQ9UKG9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CROTQ9UKG9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CROTQ9UKG9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CROTQ9UKG9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CROTQ9UKG9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CROTQ9UKG9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CROTQ9UKG9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CROTQ9UKG9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CROTQ9UKG9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CROTQ9UKG9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CROTQ9UKG9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CROTQ9UKG9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CROTQ9UKG9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CROTQ9UKG9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CROTQ9UKG9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CROTQ9UKG9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CROTQ9UKG9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms