Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LCMT1Q9UIC8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LCMT1Q9UIC8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LCMT1Q9UIC8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LCMT1Q9UIC8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LCMT1Q9UIC8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LCMT1Q9UIC8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LCMT1Q9UIC8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LCMT1Q9UIC8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCMT1Q9UIC8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCMT1Q9UIC8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LCMT1Q9UIC8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LCMT1Q9UIC8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LCMT1Q9UIC8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LCMT1Q9UIC8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LCMT1Q9UIC8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCMT1Q9UIC8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LCMT1Q9UIC8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LCMT1Q9UIC8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LCMT1Q9UIC8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LCMT1Q9UIC8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LCMT1Q9UIC8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LCMT1Q9UIC8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LCMT1Q9UIC8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCMT1Q9UIC8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LCMT1Q9UIC8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms