Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEF1Q9UBV8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEF1Q9UBV8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEF1Q9UBV8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEF1Q9UBV8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PEF1Q9UBV8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEF1Q9UBV8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEF1Q9UBV8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEF1Q9UBV8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEF1Q9UBV8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEF1Q9UBV8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEF1Q9UBV8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEF1Q9UBV8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEF1Q9UBV8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEF1Q9UBV8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PEF1Q9UBV8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEF1Q9UBV8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEF1Q9UBV8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms