Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD2Q9UBB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD2Q9UBB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD2Q9UBB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD2Q9UBB5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MBD2Q9UBB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MBD2Q9UBB5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD2Q9UBB5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD2Q9UBB5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD2Q9UBB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD2Q9UBB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD2Q9UBB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD2Q9UBB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD2Q9UBB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD2Q9UBB5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MBD2Q9UBB5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD2Q9UBB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD2Q9UBB5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD2Q9UBB5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD2Q9UBB5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD2Q9UBB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD2Q9UBB5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD2Q9UBB5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD2Q9UBB5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD2Q9UBB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD2Q9UBB5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD2Q9UBB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD2Q9UBB5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD2Q9UBB5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD2Q9UBB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD2Q9UBB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms