Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCC2Q9P258 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCC2Q9P258 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCC2Q9P258 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RCC2Q9P258 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCC2Q9P258 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCC2Q9P258 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCC2Q9P258 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCC2Q9P258 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCC2Q9P258 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms