Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFY2Q9P0M6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFY2Q9P0M6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFY2Q9P0M6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFY2Q9P0M6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFY2Q9P0M6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFY2Q9P0M6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFY2Q9P0M6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2AFY2Q9P0M6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFY2Q9P0M6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFY2Q9P0M6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFY2Q9P0M6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFY2Q9P0M6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFY2Q9P0M6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFY2Q9P0M6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFY2Q9P0M6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFY2Q9P0M6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFY2Q9P0M6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFY2Q9P0M6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFY2Q9P0M6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFY2Q9P0M6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFY2Q9P0M6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFY2Q9P0M6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFY2Q9P0M6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFY2Q9P0M6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFY2Q9P0M6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFY2Q9P0M6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFY2Q9P0M6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFY2Q9P0M6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFY2Q9P0M6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFY2Q9P0M6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFY2Q9P0M6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFY2Q9P0M6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFY2Q9P0M6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFY2Q9P0M6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFY2Q9P0M6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFY2Q9P0M6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFY2Q9P0M6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFY2Q9P0M6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFY2Q9P0M6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H2AFY2Q9P0M6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFY2Q9P0M6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms