Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX95

SYBU, Syntabulin, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYBUQ9NX95 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYBUQ9NX95 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYBUQ9NX95 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYBUQ9NX95 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYBUQ9NX95 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYBUQ9NX95 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYBUQ9NX95 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYBUQ9NX95 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYBUQ9NX95 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYBUQ9NX95 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYBUQ9NX95 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYBUQ9NX95 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYBUQ9NX95 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYBUQ9NX95 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYBUQ9NX95 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYBUQ9NX95 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYBUQ9NX95 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYBUQ9NX95 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYBUQ9NX95 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYBUQ9NX95 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYBUQ9NX95 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYBUQ9NX95 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYBUQ9NX95 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYBUQ9NX95 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYBUQ9NX95 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYBUQ9NX95 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYBUQ9NX95 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYBUQ9NX95 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYBUQ9NX95 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYBUQ9NX95 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYBUQ9NX95 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYBUQ9NX95 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYBUQ9NX95 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYBUQ9NX95 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms