Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLIMQ9NVW2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLIMQ9NVW2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLIMQ9NVW2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLIMQ9NVW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLIMQ9NVW2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLIMQ9NVW2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLIMQ9NVW2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RLIMQ9NVW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLIMQ9NVW2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLIMQ9NVW2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RLIMQ9NVW2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RLIMQ9NVW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RLIMQ9NVW2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLIMQ9NVW2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RLIMQ9NVW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLIMQ9NVW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RLIMQ9NVW2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RLIMQ9NVW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLIMQ9NVW2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLIMQ9NVW2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLIMQ9NVW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLIMQ9NVW2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLIMQ9NVW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLIMQ9NVW2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLIMQ9NVW2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLIMQ9NVW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLIMQ9NVW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLIMQ9NVW2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLIMQ9NVW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLIMQ9NVW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLIMQ9NVW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RLIMQ9NVW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RLIMQ9NVW2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms