Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXD2Q9NVH0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXD2Q9NVH0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXD2Q9NVH0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXD2Q9NVH0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXD2Q9NVH0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXD2Q9NVH0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXD2Q9NVH0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXD2Q9NVH0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXD2Q9NVH0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EXD2Q9NVH0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EXD2Q9NVH0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EXD2Q9NVH0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXD2Q9NVH0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXD2Q9NVH0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXD2Q9NVH0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXD2Q9NVH0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXD2Q9NVH0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXD2Q9NVH0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXD2Q9NVH0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXD2Q9NVH0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXD2Q9NVH0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms