Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDREJQ9NTG1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDREJQ9NTG1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDREJQ9NTG1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKDREJQ9NTG1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKDREJQ9NTG1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PKDREJQ9NTG1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKDREJQ9NTG1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKDREJQ9NTG1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKDREJQ9NTG1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKDREJQ9NTG1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKDREJQ9NTG1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKDREJQ9NTG1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKDREJQ9NTG1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKDREJQ9NTG1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDREJQ9NTG1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDREJQ9NTG1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKDREJQ9NTG1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDREJQ9NTG1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDREJQ9NTG1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDREJQ9NTG1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDREJQ9NTG1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKDREJQ9NTG1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDREJQ9NTG1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDREJQ9NTG1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDREJQ9NTG1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDREJQ9NTG1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDREJQ9NTG1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDREJQ9NTG1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDREJQ9NTG1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKDREJQ9NTG1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKDREJQ9NTG1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKDREJQ9NTG1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKDREJQ9NTG1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms