Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPLA3Q9NST1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA3Q9NST1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA3Q9NST1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNPLA3Q9NST1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA3Q9NST1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNPLA3Q9NST1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNPLA3Q9NST1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA3Q9NST1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA3Q9NST1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA3Q9NST1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA3Q9NST1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA3Q9NST1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNPLA3Q9NST1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNPLA3Q9NST1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA3Q9NST1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA3Q9NST1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNPLA3Q9NST1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNPLA3Q9NST1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNPLA3Q9NST1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNPLA3Q9NST1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA3Q9NST1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA3Q9NST1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNPLA3Q9NST1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNPLA3Q9NST1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA3Q9NST1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA3Q9NST1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA3Q9NST1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNPLA3Q9NST1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA3Q9NST1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA3Q9NST1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA3Q9NST1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PNPLA3Q9NST1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNPLA3Q9NST1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA3Q9NST1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNPLA3Q9NST1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA3Q9NST1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA3Q9NST1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA3Q9NST1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA3Q9NST1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA3Q9NST1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA3Q9NST1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNPLA3Q9NST1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNPLA3Q9NST1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms