Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTPS2Q9NRF8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTPS2Q9NRF8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTPS2Q9NRF8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS2Q9NRF8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTPS2Q9NRF8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTPS2Q9NRF8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTPS2Q9NRF8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTPS2Q9NRF8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTPS2Q9NRF8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTPS2Q9NRF8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTPS2Q9NRF8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTPS2Q9NRF8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTPS2Q9NRF8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTPS2Q9NRF8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTPS2Q9NRF8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTPS2Q9NRF8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTPS2Q9NRF8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTPS2Q9NRF8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms