Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SH2B1Q9NRF2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SH2B1Q9NRF2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SH2B1Q9NRF2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SH2B1Q9NRF2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SH2B1Q9NRF2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SH2B1Q9NRF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SH2B1Q9NRF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SH2B1Q9NRF2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SH2B1Q9NRF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SH2B1Q9NRF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SH2B1Q9NRF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SH2B1Q9NRF2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SH2B1Q9NRF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SH2B1Q9NRF2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SH2B1Q9NRF2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SH2B1Q9NRF2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SH2B1Q9NRF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SH2B1Q9NRF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SH2B1Q9NRF2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SH2B1Q9NRF2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SH2B1Q9NRF2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SH2B1Q9NRF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SH2B1Q9NRF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SH2B1Q9NRF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SH2B1Q9NRF2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SH2B1Q9NRF2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SH2B1Q9NRF2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SH2B1Q9NRF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SH2B1Q9NRF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SH2B1Q9NRF2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SH2B1Q9NRF2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SH2B1Q9NRF2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SH2B1Q9NRF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SH2B1Q9NRF2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SH2B1Q9NRF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SH2B1Q9NRF2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SH2B1Q9NRF2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SH2B1Q9NRF2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SH2B1Q9NRF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SH2B1Q9NRF2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SH2B1Q9NRF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SH2B1Q9NRF2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SH2B1Q9NRF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SH2B1Q9NRF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SH2B1Q9NRF2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SH2B1Q9NRF2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SH2B1Q9NRF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SH2B1Q9NRF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SH2B1Q9NRF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SH2B1Q9NRF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SH2B1Q9NRF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SH2B1Q9NRF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SH2B1Q9NRF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SH2B1Q9NRF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SH2B1Q9NRF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SH2B1Q9NRF2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SH2B1Q9NRF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SH2B1Q9NRF2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SH2B1Q9NRF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SH2B1Q9NRF2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SH2B1Q9NRF2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms