Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO6Q9NRD1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO6Q9NRD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO6Q9NRD1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO6Q9NRD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO6Q9NRD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO6Q9NRD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO6Q9NRD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO6Q9NRD1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO6Q9NRD1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO6Q9NRD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO6Q9NRD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO6Q9NRD1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO6Q9NRD1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FBXO6Q9NRD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO6Q9NRD1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO6Q9NRD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO6Q9NRD1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO6Q9NRD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO6Q9NRD1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO6Q9NRD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO6Q9NRD1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO6Q9NRD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO6Q9NRD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO6Q9NRD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FBXO6Q9NRD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO6Q9NRD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO6Q9NRD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO6Q9NRD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO6Q9NRD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO6Q9NRD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO6Q9NRD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO6Q9NRD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms