Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACSS2Q9NR19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACSS2Q9NR19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ACSS2Q9NR19 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACSS2Q9NR19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ACSS2Q9NR19 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACSS2Q9NR19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACSS2Q9NR19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACSS2Q9NR19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACSS2Q9NR19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACSS2Q9NR19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACSS2Q9NR19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACSS2Q9NR19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACSS2Q9NR19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACSS2Q9NR19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACSS2Q9NR19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACSS2Q9NR19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACSS2Q9NR19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACSS2Q9NR19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACSS2Q9NR19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACSS2Q9NR19 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACSS2Q9NR19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACSS2Q9NR19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACSS2Q9NR19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACSS2Q9NR19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACSS2Q9NR19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACSS2Q9NR19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACSS2Q9NR19 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACSS2Q9NR19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACSS2Q9NR19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ACSS2Q9NR19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACSS2Q9NR19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACSS2Q9NR19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACSS2Q9NR19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACSS2Q9NR19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACSS2Q9NR19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACSS2Q9NR19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms